Die FAKULTÄT FÜR INFORMATIK an der TU Wien lädt zu folgendem Vortrag ein: ======================================================================== Professor Herbert Edelsbrunner Arts and Sciences Professor of Computer Science and Mathematics Duke University, NC, USA Datum: Montag, 20. Juni 2005 Uhrzeit: 17.00 Uhr pünktlich Ort: Hörsaal EI 9 (Hlawka-Hs), TU Wien, Gußhausstr. 27-29, Erdgeschoss Im Anschluss lädt die Informatik-Fakultät zur informellen Diskussion bei Snacks und Erfrischungen. ======================================================================== TITEL: Protein Docking with Elevation ======================================================================== ABSTRACT: Protein docking is the computational approach to predicting protein interaction, which lies at the heart of the functioning of living organisms. A main indicator or interaction is local shape complementarity, but the relation is not direct and complicated by the flexibility of proteins and the frequently less than perfect fit. An approach to finding local shape complementarity based on Morse theory has been pioneered by Michael Connolly about two decades ago. He used the critical points of a local volume function to mark cavities and protrusions and used these points to generate candidate configurations. The approach has found limited success, but we believe that a scale-independent function goes a long way to overcome the original shortcomings. In this talk, we introduce such a function, referred to as the elevation of a protein surface or, more generally, a 2-manifold embedded in three-dimensional space. We then repeat Connolly's approach and report our findings in applying the developed software to a suite of standard protein docking problems. ======================================================================== Kurzbiographie zu Professor Herbert Edelsbrunner ======================================================================== Herbert Edelsbrunner zählt heute zur Weltspitze im Bereich algorithmische Geometríe Er promovierte 1982 an der Technischen Universität in Graz, und wurde 1990 als jüngster Full Professor an die University of Illinois Urbana-Champaign berufen, in das Institut für Computer Wissenschaften. 1991 erhielt er den Alan T. Waterman Preis von der National Science Foundation in den U.S.A. Er ist Gründer und Direktor von Raindrop Geomagic, einer Firma für drei-dimensional geometrische Modelierungs Software. Seit August 1999 ist er Arts and Sciences Professor für Computer Wissenschaften an der Duke University in North Carolina. Er forscht in den Gebieten Datenstrukturen, Algorithmen, Geometrie, und Toplogie. Er hat weit über hundert wissenschaftliche Arbeiten veröffentlicht und ist Autor eines Standardwerkes über algorithmische Geometrie, erschienen 1987 bei Springer-Verlag. Weitere Informationen über den Vortragenden finden Sie auf http://www.cs.duke.edu/~edels ------------------------------------------------------------------------ Kontaktperson an der TU Wien: Prof. Dr. Walter Kropatsch, Tel. 58801-18350, email krw@prip.tuwien.ac.at Die Finanzierung dieser Veranstaltung erfolgt durch das Institut für Rechnergestützte Automation und die TU Wien ------------------------------------------------------------------------ Die Fakultät für Informatik erhält Sponsorgelder u.a. von - Siemens AG Österreich - Dr. Karl Kleissner ------------------------------------------------------------------------